Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C0C1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C0C1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C0C1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C0C1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C0C1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C0C1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C0C1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C0C1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C0C1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C0C1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H7C0C1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H7C0C1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C0C1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C0C1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C0C1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C0C1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C0C1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C0C1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C0C1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C0C1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C0C1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C0C1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C0C1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C0C1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C0C1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C0C1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C0C1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C0C1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C0C1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C0C1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C0C1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C0C1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C0C1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C0C1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C0C1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C0C1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C0C1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C0C1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C0C1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C0C1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C0C1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C0C1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C0C1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C0C1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C0C1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C0C1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C0C1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C0C1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C0C1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C0C1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C0C1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C0C1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C0C1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C0C1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C0C1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C0C1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C0C1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C0C1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C0C1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C0C1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C0C1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C0C1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C0C1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C0C1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C0C1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C0C1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C0C1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C0C1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C0C1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C0C1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C0C1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C0C1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C0C1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C0C1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H7C0C1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H7C0C1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H7C0C1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
H7C0C1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C0C1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C0C1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C0C1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C0C1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C0C1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C0C1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C0C1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C0C1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C0C1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C0C1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C0C1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms