Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STX16-NPEPL1H3BU86 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STX16-NPEPL1H3BU86 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms