Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BML4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BML4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BML4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BML4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BML4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BML4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BML4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BML4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BML4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BML4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BML4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BML4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BML4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BML4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BML4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BML4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BML4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BML4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BML4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BML4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BML4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BML4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BML4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BML4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BML4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3BML4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BML4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BML4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BML4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BML4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BML4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BML4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BML4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BML4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BML4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BML4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BML4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BML4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BML4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BML4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BML4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BML4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BML4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BML4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BML4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BML4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BML4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BML4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BML4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BML4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BML4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BML4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BML4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BML4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BML4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BML4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BML4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BML4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BML4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BML4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BML4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BML4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BML4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BML4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BML4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BML4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BML4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BML4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BML4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BML4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BML4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BML4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BML4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BML4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BML4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H3BML4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H3BML4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms