Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM49D1C9J1S8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM49D1C9J1S8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms