Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00587B1AMM8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00587B1AMM8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00587B1AMM8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00587B1AMM8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00587B1AMM8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00587B1AMM8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00587B1AMM8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00587B1AMM8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00587B1AMM8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00587B1AMM8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00587B1AMM8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00587B1AMM8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms