Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CD8B2A6NJW9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD8B2A6NJW9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms