Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF316A6NFI3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ZNF316A6NFI3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ZNF316A6NFI3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF316A6NFI3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms