Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP17L3A6NCW0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP17L3A6NCW0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms