Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRBA1A5PL33 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRBA1A5PL33 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRBA1A5PL33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms