Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSAPA4D1B5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSAPA4D1B5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSAPA4D1B5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms