Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLRN2A0PK11 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLRN2A0PK11 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLRN2A0PK11 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLRN2A0PK11 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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