Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAARA0A1B0GVQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPAARA0A1B0GVQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPAARA0A1B0GVQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPAARA0A1B0GVQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPAARA0A1B0GVQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms