Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A087WXM4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A087WXM4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A087WXM4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A087WXM4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087WXM4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087WXM4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087WXM4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087WXM4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A087WXM4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms