Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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