Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL20Q9Y2M5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms