Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms