Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RAB18Q9NP72 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms