Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF304Q9HCX3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms