Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms