Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms