Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC106Q9BWC9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC106Q9BWC9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms