Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHOX2BQ99453 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms