Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms