Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00523Q86TU6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms