Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM72Q6ZMU5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms