Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
C16orf54Q6UWD8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms