Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSSK4Q6SA08 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms