Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms