Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM9

PRR27, Proline-rich protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR27Q6MZM9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR27Q6MZM9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms