Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPGRIP1LQ68CZ1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms