Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP13-3Q3SY46 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms