Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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