Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NPTX1Q15818 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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