Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms