Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTH1Q15438 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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