Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRIN2CQ14957 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GRIN2CQ14957 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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