Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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