Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms