Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VBP1P61758 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VBP1P61758 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VBP1P61758 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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