Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms