Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC1P48995 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms