Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC4A3P48751 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms