Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZEB1P37275 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZEB1P37275 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms