Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CHRNA7P36544 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms