Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2CP19387 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms