Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCL3L1P16619 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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