Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP2C9P11712 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms