Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTMAP06454 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTMAP06454 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms