Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.4 ms