Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA10O75578 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms